Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQX4

Pclaf, PCNA-associated factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PclafQ9CQX4 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PclafQ9CQX4 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PclafQ9CQX4 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PclafQ9CQX4 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PclafQ9CQX4 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PclafQ9CQX4 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PclafQ9CQX4 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PclafQ9CQX4 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PclafQ9CQX4 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PclafQ9CQX4 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PclafQ9CQX4 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PclafQ9CQX4 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PclafQ9CQX4 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PclafQ9CQX4 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PclafQ9CQX4 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PclafQ9CQX4 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PclafQ9CQX4 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PclafQ9CQX4 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PclafQ9CQX4 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PclafQ9CQX4 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PclafQ9CQX4 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PclafQ9CQX4 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PclafQ9CQX4 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PclafQ9CQX4 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PclafQ9CQX4 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PclafQ9CQX4 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PclafQ9CQX4 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PclafQ9CQX4 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PclafQ9CQX4 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PclafQ9CQX4 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PclafQ9CQX4 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PclafQ9CQX4 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PclafQ9CQX4 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PclafQ9CQX4 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PclafQ9CQX4 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PclafQ9CQX4 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PclafQ9CQX4 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PclafQ9CQX4 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PclafQ9CQX4 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PclafQ9CQX4 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PclafQ9CQX4 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PclafQ9CQX4 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PclafQ9CQX4 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PclafQ9CQX4 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PclafQ9CQX4 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PclafQ9CQX4 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PclafQ9CQX4 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PclafQ9CQX4 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PclafQ9CQX4 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PclafQ9CQX4 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PclafQ9CQX4 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PclafQ9CQX4 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PclafQ9CQX4 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PclafQ9CQX4 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PclafQ9CQX4 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PclafQ9CQX4 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PclafQ9CQX4 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PclafQ9CQX4 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PclafQ9CQX4 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PclafQ9CQX4 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PclafQ9CQX4 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PclafQ9CQX4 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PclafQ9CQX4 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PclafQ9CQX4 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PclafQ9CQX4 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PclafQ9CQX4 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PclafQ9CQX4 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PclafQ9CQX4 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PclafQ9CQX4 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PclafQ9CQX4 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PclafQ9CQX4 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PclafQ9CQX4 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PclafQ9CQX4 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PclafQ9CQX4 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PclafQ9CQX4 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PclafQ9CQX4 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PclafQ9CQX4 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PclafQ9CQX4 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PclafQ9CQX4 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PclafQ9CQX4 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PclafQ9CQX4 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PclafQ9CQX4 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PclafQ9CQX4 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PclafQ9CQX4 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PclafQ9CQX4 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PclafQ9CQX4 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PclafQ9CQX4 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PclafQ9CQX4 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PclafQ9CQX4 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PclafQ9CQX4 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PclafQ9CQX4 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PclafQ9CQX4 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PclafQ9CQX4 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PclafQ9CQX4 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PclafQ9CQX4 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PclafQ9CQX4 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PclafQ9CQX4 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PclafQ9CQX4 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PclafQ9CQX4 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PclafQ9CQX4 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms