Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms