Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF3

Nudt21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt21Q9CQF3 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nudt21Q9CQF3 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Nudt21Q9CQF3 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nudt21Q9CQF3 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nudt21Q9CQF3 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nudt21Q9CQF3 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nudt21Q9CQF3 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nudt21Q9CQF3 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nudt21Q9CQF3 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nudt21Q9CQF3 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Nudt21Q9CQF3 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nudt21Q9CQF3 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nudt21Q9CQF3 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Nudt21Q9CQF3 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Nudt21Q9CQF3 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nudt21Q9CQF3 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nudt21Q9CQF3 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nudt21Q9CQF3 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nudt21Q9CQF3 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nudt21Q9CQF3 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nudt21Q9CQF3 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Nudt21Q9CQF3 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nudt21Q9CQF3 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nudt21Q9CQF3 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nudt21Q9CQF3 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nudt21Q9CQF3 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nudt21Q9CQF3 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nudt21Q9CQF3 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nudt21Q9CQF3 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nudt21Q9CQF3 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nudt21Q9CQF3 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nudt21Q9CQF3 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nudt21Q9CQF3 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nudt21Q9CQF3 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Nudt21Q9CQF3 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nudt21Q9CQF3 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nudt21Q9CQF3 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nudt21Q9CQF3 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nudt21Q9CQF3 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nudt21Q9CQF3 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nudt21Q9CQF3 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nudt21Q9CQF3 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nudt21Q9CQF3 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nudt21Q9CQF3 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nudt21Q9CQF3 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nudt21Q9CQF3 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nudt21Q9CQF3 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nudt21Q9CQF3 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Nudt21Q9CQF3 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nudt21Q9CQF3 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nudt21Q9CQF3 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nudt21Q9CQF3 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Nudt21Q9CQF3 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Nudt21Q9CQF3 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nudt21Q9CQF3 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nudt21Q9CQF3 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nudt21Q9CQF3 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nudt21Q9CQF3 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Nudt21Q9CQF3 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nudt21Q9CQF3 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nudt21Q9CQF3 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nudt21Q9CQF3 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nudt21Q9CQF3 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nudt21Q9CQF3 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nudt21Q9CQF3 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nudt21Q9CQF3 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nudt21Q9CQF3 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nudt21Q9CQF3 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nudt21Q9CQF3 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nudt21Q9CQF3 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nudt21Q9CQF3 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Nudt21Q9CQF3 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nudt21Q9CQF3 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nudt21Q9CQF3 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nudt21Q9CQF3 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nudt21Q9CQF3 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nudt21Q9CQF3 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Nudt21Q9CQF3 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nudt21Q9CQF3 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nudt21Q9CQF3 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nudt21Q9CQF3 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nudt21Q9CQF3 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nudt21Q9CQF3 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nudt21Q9CQF3 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Nudt21Q9CQF3 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nudt21Q9CQF3 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nudt21Q9CQF3 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Nudt21Q9CQF3 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nudt21Q9CQF3 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nudt21Q9CQF3 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nudt21Q9CQF3 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nudt21Q9CQF3 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nudt21Q9CQF3 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nudt21Q9CQF3 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nudt21Q9CQF3 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nudt21Q9CQF3 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nudt21Q9CQF3 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nudt21Q9CQF3 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nudt21Q9CQF3 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nudt21Q9CQF3 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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