Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB9

Sf3b1, Splicing factor 3B subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b1Q99NB9 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sf3b1Q99NB9 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sf3b1Q99NB9 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sf3b1Q99NB9 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sf3b1Q99NB9 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sf3b1Q99NB9 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sf3b1Q99NB9 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sf3b1Q99NB9 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sf3b1Q99NB9 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sf3b1Q99NB9 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sf3b1Q99NB9 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sf3b1Q99NB9 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sf3b1Q99NB9 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sf3b1Q99NB9 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sf3b1Q99NB9 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Sf3b1Q99NB9 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sf3b1Q99NB9 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Sf3b1Q99NB9 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sf3b1Q99NB9 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sf3b1Q99NB9 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sf3b1Q99NB9 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sf3b1Q99NB9 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sf3b1Q99NB9 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sf3b1Q99NB9 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sf3b1Q99NB9 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sf3b1Q99NB9 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sf3b1Q99NB9 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sf3b1Q99NB9 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sf3b1Q99NB9 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Sf3b1Q99NB9 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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Sf3b1Q99NB9 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sf3b1Q99NB9 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sf3b1Q99NB9 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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Sf3b1Q99NB9 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Sf3b1Q99NB9 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Sf3b1Q99NB9 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Sf3b1Q99NB9 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sf3b1Q99NB9 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sf3b1Q99NB9 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sf3b1Q99NB9 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sf3b1Q99NB9 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sf3b1Q99NB9 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sf3b1Q99NB9 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sf3b1Q99NB9 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sf3b1Q99NB9 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sf3b1Q99NB9 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sf3b1Q99NB9 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sf3b1Q99NB9 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sf3b1Q99NB9 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sf3b1Q99NB9 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sf3b1Q99NB9 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sf3b1Q99NB9 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sf3b1Q99NB9 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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