Protein–RNA interactions for Protein: Q99MQ3

Pink1, Serine/threonine-protein kinase PINK1, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pink1Q99MQ3 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pink1Q99MQ3 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pink1Q99MQ3 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pink1Q99MQ3 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pink1Q99MQ3 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pink1Q99MQ3 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pink1Q99MQ3 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pink1Q99MQ3 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pink1Q99MQ3 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pink1Q99MQ3 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pink1Q99MQ3 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pink1Q99MQ3 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pink1Q99MQ3 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pink1Q99MQ3 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pink1Q99MQ3 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pink1Q99MQ3 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pink1Q99MQ3 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pink1Q99MQ3 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pink1Q99MQ3 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pink1Q99MQ3 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Pink1Q99MQ3 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pink1Q99MQ3 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pink1Q99MQ3 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pink1Q99MQ3 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pink1Q99MQ3 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pink1Q99MQ3 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pink1Q99MQ3 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pink1Q99MQ3 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pink1Q99MQ3 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pink1Q99MQ3 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pink1Q99MQ3 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Pink1Q99MQ3 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pink1Q99MQ3 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Pink1Q99MQ3 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Pink1Q99MQ3 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pink1Q99MQ3 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pink1Q99MQ3 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Pink1Q99MQ3 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Pink1Q99MQ3 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pink1Q99MQ3 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pink1Q99MQ3 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pink1Q99MQ3 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pink1Q99MQ3 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pink1Q99MQ3 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pink1Q99MQ3 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pink1Q99MQ3 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pink1Q99MQ3 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pink1Q99MQ3 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pink1Q99MQ3 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pink1Q99MQ3 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pink1Q99MQ3 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pink1Q99MQ3 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pink1Q99MQ3 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pink1Q99MQ3 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pink1Q99MQ3 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pink1Q99MQ3 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Pink1Q99MQ3 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Pink1Q99MQ3 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Pink1Q99MQ3 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pink1Q99MQ3 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pink1Q99MQ3 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pink1Q99MQ3 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pink1Q99MQ3 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pink1Q99MQ3 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pink1Q99MQ3 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pink1Q99MQ3 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pink1Q99MQ3 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pink1Q99MQ3 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pink1Q99MQ3 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pink1Q99MQ3 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pink1Q99MQ3 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pink1Q99MQ3 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pink1Q99MQ3 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pink1Q99MQ3 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pink1Q99MQ3 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pink1Q99MQ3 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pink1Q99MQ3 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pink1Q99MQ3 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pink1Q99MQ3 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pink1Q99MQ3 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pink1Q99MQ3 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pink1Q99MQ3 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pink1Q99MQ3 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pink1Q99MQ3 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pink1Q99MQ3 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pink1Q99MQ3 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pink1Q99MQ3 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pink1Q99MQ3 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pink1Q99MQ3 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pink1Q99MQ3 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pink1Q99MQ3 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pink1Q99MQ3 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pink1Q99MQ3 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pink1Q99MQ3 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pink1Q99MQ3 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pink1Q99MQ3 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pink1Q99MQ3 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pink1Q99MQ3 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pink1Q99MQ3 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pink1Q99MQ3 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms