Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

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Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PtprtQ99M80 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PtprtQ99M80 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PtprtQ99M80 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PtprtQ99M80 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PtprtQ99M80 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PtprtQ99M80 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PtprtQ99M80 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PtprtQ99M80 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PtprtQ99M80 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PtprtQ99M80 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PtprtQ99M80 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PtprtQ99M80 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PtprtQ99M80 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PtprtQ99M80 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PtprtQ99M80 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PtprtQ99M80 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PtprtQ99M80 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PtprtQ99M80 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PtprtQ99M80 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PtprtQ99M80 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PtprtQ99M80 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PtprtQ99M80 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PtprtQ99M80 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PtprtQ99M80 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PtprtQ99M80 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PtprtQ99M80 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PtprtQ99M80 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PtprtQ99M80 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PtprtQ99M80 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PtprtQ99M80 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PtprtQ99M80 Ccdc153-201ENSMUST00000092426 1087 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PtprtQ99M80 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PtprtQ99M80 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PtprtQ99M80 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PtprtQ99M80 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PtprtQ99M80 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PtprtQ99M80 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PtprtQ99M80 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PtprtQ99M80 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PtprtQ99M80 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PtprtQ99M80 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PtprtQ99M80 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PtprtQ99M80 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PtprtQ99M80 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PtprtQ99M80 D3Ertd751e-215ENSMUST00000195882 680 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PtprtQ99M80 Gm17889-201ENSMUST00000198410 598 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PtprtQ99M80 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PtprtQ99M80 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PtprtQ99M80 Rab7-201ENSMUST00000095048 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PtprtQ99M80 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PtprtQ99M80 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PtprtQ99M80 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PtprtQ99M80 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PtprtQ99M80 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PtprtQ99M80 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PtprtQ99M80 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PtprtQ99M80 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PtprtQ99M80 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PtprtQ99M80 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PtprtQ99M80 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PtprtQ99M80 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PtprtQ99M80 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PtprtQ99M80 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
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PtprtQ99M80 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PtprtQ99M80 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PtprtQ99M80 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PtprtQ99M80 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PtprtQ99M80 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PtprtQ99M80 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PtprtQ99M80 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PtprtQ99M80 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PtprtQ99M80 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PtprtQ99M80 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PtprtQ99M80 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PtprtQ99M80 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PtprtQ99M80 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PtprtQ99M80 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PtprtQ99M80 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PtprtQ99M80 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PtprtQ99M80 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PtprtQ99M80 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PtprtQ99M80 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PtprtQ99M80 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PtprtQ99M80 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PtprtQ99M80 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PtprtQ99M80 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PtprtQ99M80 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PtprtQ99M80 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PtprtQ99M80 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PtprtQ99M80 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PtprtQ99M80 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PtprtQ99M80 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PtprtQ99M80 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms