Protein–RNA interactions for Protein: Q99LH9

Sh3bp5l, SH3 domain-binding protein 5-like, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5lQ99LH9 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh3bp5lQ99LH9 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh3bp5lQ99LH9 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh3bp5lQ99LH9 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh3bp5lQ99LH9 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh3bp5lQ99LH9 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh3bp5lQ99LH9 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh3bp5lQ99LH9 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh3bp5lQ99LH9 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh3bp5lQ99LH9 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh3bp5lQ99LH9 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sh3bp5lQ99LH9 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Sh3bp5lQ99LH9 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sh3bp5lQ99LH9 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sh3bp5lQ99LH9 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sh3bp5lQ99LH9 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sh3bp5lQ99LH9 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sh3bp5lQ99LH9 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Sh3bp5lQ99LH9 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
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Sh3bp5lQ99LH9 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sh3bp5lQ99LH9 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sh3bp5lQ99LH9 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sh3bp5lQ99LH9 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
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Sh3bp5lQ99LH9 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sh3bp5lQ99LH9 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sh3bp5lQ99LH9 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sh3bp5lQ99LH9 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sh3bp5lQ99LH9 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sh3bp5lQ99LH9 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sh3bp5lQ99LH9 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sh3bp5lQ99LH9 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sh3bp5lQ99LH9 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sh3bp5lQ99LH9 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sh3bp5lQ99LH9 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sh3bp5lQ99LH9 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sh3bp5lQ99LH9 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sh3bp5lQ99LH9 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sh3bp5lQ99LH9 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh3bp5lQ99LH9 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh3bp5lQ99LH9 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh3bp5lQ99LH9 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh3bp5lQ99LH9 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh3bp5lQ99LH9 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Sh3bp5lQ99LH9 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Sh3bp5lQ99LH9 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh3bp5lQ99LH9 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh3bp5lQ99LH9 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Sh3bp5lQ99LH9 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Sh3bp5lQ99LH9 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh3bp5lQ99LH9 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh3bp5lQ99LH9 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh3bp5lQ99LH9 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Sh3bp5lQ99LH9 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sh3bp5lQ99LH9 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sh3bp5lQ99LH9 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sh3bp5lQ99LH9 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sh3bp5lQ99LH9 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sh3bp5lQ99LH9 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sh3bp5lQ99LH9 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sh3bp5lQ99LH9 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sh3bp5lQ99LH9 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sh3bp5lQ99LH9 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
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Sh3bp5lQ99LH9 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sh3bp5lQ99LH9 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sh3bp5lQ99LH9 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sh3bp5lQ99LH9 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sh3bp5lQ99LH9 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sh3bp5lQ99LH9 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sh3bp5lQ99LH9 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sh3bp5lQ99LH9 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sh3bp5lQ99LH9 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sh3bp5lQ99LH9 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sh3bp5lQ99LH9 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sh3bp5lQ99LH9 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sh3bp5lQ99LH9 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sh3bp5lQ99LH9 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sh3bp5lQ99LH9 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sh3bp5lQ99LH9 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sh3bp5lQ99LH9 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sh3bp5lQ99LH9 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sh3bp5lQ99LH9 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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