Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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