Protein–RNA interactions for Protein: Q99KL7

Rab28, Ras-related protein Rab-28, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab28Q99KL7 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms