Protein–RNA interactions for Protein: Q99KJ0

Ubxn2a, UBX domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2aQ99KJ0 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubxn2aQ99KJ0 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubxn2aQ99KJ0 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubxn2aQ99KJ0 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubxn2aQ99KJ0 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubxn2aQ99KJ0 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubxn2aQ99KJ0 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubxn2aQ99KJ0 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubxn2aQ99KJ0 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubxn2aQ99KJ0 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubxn2aQ99KJ0 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubxn2aQ99KJ0 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubxn2aQ99KJ0 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubxn2aQ99KJ0 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubxn2aQ99KJ0 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubxn2aQ99KJ0 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubxn2aQ99KJ0 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubxn2aQ99KJ0 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubxn2aQ99KJ0 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubxn2aQ99KJ0 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubxn2aQ99KJ0 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubxn2aQ99KJ0 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubxn2aQ99KJ0 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubxn2aQ99KJ0 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubxn2aQ99KJ0 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubxn2aQ99KJ0 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubxn2aQ99KJ0 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubxn2aQ99KJ0 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubxn2aQ99KJ0 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubxn2aQ99KJ0 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubxn2aQ99KJ0 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubxn2aQ99KJ0 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubxn2aQ99KJ0 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubxn2aQ99KJ0 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubxn2aQ99KJ0 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubxn2aQ99KJ0 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubxn2aQ99KJ0 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubxn2aQ99KJ0 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubxn2aQ99KJ0 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubxn2aQ99KJ0 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubxn2aQ99KJ0 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubxn2aQ99KJ0 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubxn2aQ99KJ0 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubxn2aQ99KJ0 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubxn2aQ99KJ0 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubxn2aQ99KJ0 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubxn2aQ99KJ0 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubxn2aQ99KJ0 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubxn2aQ99KJ0 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubxn2aQ99KJ0 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubxn2aQ99KJ0 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubxn2aQ99KJ0 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubxn2aQ99KJ0 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubxn2aQ99KJ0 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubxn2aQ99KJ0 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubxn2aQ99KJ0 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubxn2aQ99KJ0 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubxn2aQ99KJ0 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubxn2aQ99KJ0 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubxn2aQ99KJ0 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubxn2aQ99KJ0 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubxn2aQ99KJ0 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubxn2aQ99KJ0 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubxn2aQ99KJ0 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubxn2aQ99KJ0 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubxn2aQ99KJ0 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubxn2aQ99KJ0 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubxn2aQ99KJ0 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubxn2aQ99KJ0 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubxn2aQ99KJ0 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubxn2aQ99KJ0 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubxn2aQ99KJ0 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubxn2aQ99KJ0 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubxn2aQ99KJ0 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubxn2aQ99KJ0 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubxn2aQ99KJ0 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubxn2aQ99KJ0 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubxn2aQ99KJ0 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubxn2aQ99KJ0 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubxn2aQ99KJ0 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubxn2aQ99KJ0 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubxn2aQ99KJ0 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubxn2aQ99KJ0 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubxn2aQ99KJ0 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubxn2aQ99KJ0 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubxn2aQ99KJ0 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubxn2aQ99KJ0 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubxn2aQ99KJ0 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubxn2aQ99KJ0 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubxn2aQ99KJ0 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubxn2aQ99KJ0 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubxn2aQ99KJ0 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubxn2aQ99KJ0 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubxn2aQ99KJ0 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubxn2aQ99KJ0 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubxn2aQ99KJ0 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ubxn2aQ99KJ0 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ubxn2aQ99KJ0 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ubxn2aQ99KJ0 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ubxn2aQ99KJ0 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms