Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms