Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms