Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

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Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
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Ctu1Q99J10 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Ctu1Q99J10 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Ctu1Q99J10 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Ctu1Q99J10 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms