Protein–RNA interactions for Protein: Q925I7

Pdgfd, Platelet-derived growth factor D, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfdQ925I7 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PdgfdQ925I7 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PdgfdQ925I7 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PdgfdQ925I7 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PdgfdQ925I7 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdgfdQ925I7 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdgfdQ925I7 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdgfdQ925I7 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdgfdQ925I7 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdgfdQ925I7 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdgfdQ925I7 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdgfdQ925I7 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdgfdQ925I7 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdgfdQ925I7 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PdgfdQ925I7 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
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PdgfdQ925I7 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdgfdQ925I7 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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PdgfdQ925I7 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdgfdQ925I7 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdgfdQ925I7 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdgfdQ925I7 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdgfdQ925I7 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdgfdQ925I7 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdgfdQ925I7 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdgfdQ925I7 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdgfdQ925I7 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdgfdQ925I7 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdgfdQ925I7 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdgfdQ925I7 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdgfdQ925I7 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdgfdQ925I7 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdgfdQ925I7 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdgfdQ925I7 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdgfdQ925I7 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdgfdQ925I7 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdgfdQ925I7 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
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PdgfdQ925I7 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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PdgfdQ925I7 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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PdgfdQ925I7 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PdgfdQ925I7 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PdgfdQ925I7 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PdgfdQ925I7 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PdgfdQ925I7 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PdgfdQ925I7 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PdgfdQ925I7 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PdgfdQ925I7 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PdgfdQ925I7 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PdgfdQ925I7 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PdgfdQ925I7 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PdgfdQ925I7 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PdgfdQ925I7 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PdgfdQ925I7 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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PdgfdQ925I7 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.9 ms