Protein–RNA interactions for Protein: Q922J3

Clip1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip1Q922J3 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Clip1Q922J3 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Clip1Q922J3 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Clip1Q922J3 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Clip1Q922J3 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Clip1Q922J3 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Clip1Q922J3 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Clip1Q922J3 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Clip1Q922J3 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Clip1Q922J3 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Clip1Q922J3 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Clip1Q922J3 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Clip1Q922J3 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Clip1Q922J3 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Clip1Q922J3 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Clip1Q922J3 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Clip1Q922J3 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Clip1Q922J3 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Clip1Q922J3 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Clip1Q922J3 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Clip1Q922J3 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Clip1Q922J3 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Clip1Q922J3 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Clip1Q922J3 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Clip1Q922J3 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Clip1Q922J3 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Clip1Q922J3 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Clip1Q922J3 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Clip1Q922J3 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Clip1Q922J3 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Clip1Q922J3 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Clip1Q922J3 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Clip1Q922J3 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Clip1Q922J3 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Clip1Q922J3 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Clip1Q922J3 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Clip1Q922J3 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Clip1Q922J3 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Clip1Q922J3 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Clip1Q922J3 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Clip1Q922J3 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Clip1Q922J3 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Clip1Q922J3 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Clip1Q922J3 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Clip1Q922J3 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Clip1Q922J3 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Clip1Q922J3 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Clip1Q922J3 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Clip1Q922J3 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Clip1Q922J3 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Clip1Q922J3 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Clip1Q922J3 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Clip1Q922J3 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Clip1Q922J3 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Clip1Q922J3 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Clip1Q922J3 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Clip1Q922J3 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Clip1Q922J3 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clip1Q922J3 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clip1Q922J3 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clip1Q922J3 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clip1Q922J3 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clip1Q922J3 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clip1Q922J3 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clip1Q922J3 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clip1Q922J3 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clip1Q922J3 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clip1Q922J3 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clip1Q922J3 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clip1Q922J3 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clip1Q922J3 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clip1Q922J3 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Clip1Q922J3 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Clip1Q922J3 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Clip1Q922J3 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clip1Q922J3 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clip1Q922J3 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clip1Q922J3 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clip1Q922J3 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clip1Q922J3 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clip1Q922J3 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clip1Q922J3 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clip1Q922J3 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clip1Q922J3 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clip1Q922J3 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clip1Q922J3 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clip1Q922J3 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clip1Q922J3 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clip1Q922J3 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clip1Q922J3 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Clip1Q922J3 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clip1Q922J3 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clip1Q922J3 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clip1Q922J3 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clip1Q922J3 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clip1Q922J3 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clip1Q922J3 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clip1Q922J3 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Clip1Q922J3 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clip1Q922J3 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms