Protein–RNA interactions for Protein: Q91W78

Usb1, U6 snRNA phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usb1Q91W78 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms