Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC5

Cabp4, Calcium-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp4Q8VHC5 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cabp4Q8VHC5 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cabp4Q8VHC5 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cabp4Q8VHC5 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cabp4Q8VHC5 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cabp4Q8VHC5 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cabp4Q8VHC5 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cabp4Q8VHC5 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Cabp4Q8VHC5 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Cabp4Q8VHC5 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cabp4Q8VHC5 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cabp4Q8VHC5 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cabp4Q8VHC5 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cabp4Q8VHC5 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cabp4Q8VHC5 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cabp4Q8VHC5 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cabp4Q8VHC5 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cabp4Q8VHC5 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cabp4Q8VHC5 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cabp4Q8VHC5 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cabp4Q8VHC5 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cabp4Q8VHC5 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cabp4Q8VHC5 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cabp4Q8VHC5 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cabp4Q8VHC5 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cabp4Q8VHC5 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cabp4Q8VHC5 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cabp4Q8VHC5 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cabp4Q8VHC5 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cabp4Q8VHC5 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cabp4Q8VHC5 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cabp4Q8VHC5 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cabp4Q8VHC5 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cabp4Q8VHC5 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cabp4Q8VHC5 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cabp4Q8VHC5 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cabp4Q8VHC5 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cabp4Q8VHC5 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cabp4Q8VHC5 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cabp4Q8VHC5 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cabp4Q8VHC5 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cabp4Q8VHC5 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cabp4Q8VHC5 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cabp4Q8VHC5 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cabp4Q8VHC5 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cabp4Q8VHC5 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cabp4Q8VHC5 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cabp4Q8VHC5 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cabp4Q8VHC5 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cabp4Q8VHC5 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cabp4Q8VHC5 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cabp4Q8VHC5 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cabp4Q8VHC5 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cabp4Q8VHC5 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cabp4Q8VHC5 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cabp4Q8VHC5 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cabp4Q8VHC5 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cabp4Q8VHC5 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cabp4Q8VHC5 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cabp4Q8VHC5 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cabp4Q8VHC5 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cabp4Q8VHC5 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cabp4Q8VHC5 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cabp4Q8VHC5 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cabp4Q8VHC5 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cabp4Q8VHC5 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cabp4Q8VHC5 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cabp4Q8VHC5 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cabp4Q8VHC5 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cabp4Q8VHC5 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cabp4Q8VHC5 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cabp4Q8VHC5 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cabp4Q8VHC5 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cabp4Q8VHC5 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cabp4Q8VHC5 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cabp4Q8VHC5 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cabp4Q8VHC5 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cabp4Q8VHC5 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cabp4Q8VHC5 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cabp4Q8VHC5 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cabp4Q8VHC5 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cabp4Q8VHC5 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cabp4Q8VHC5 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Cabp4Q8VHC5 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cabp4Q8VHC5 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cabp4Q8VHC5 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cabp4Q8VHC5 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cabp4Q8VHC5 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cabp4Q8VHC5 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cabp4Q8VHC5 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cabp4Q8VHC5 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Cabp4Q8VHC5 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Cabp4Q8VHC5 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cabp4Q8VHC5 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cabp4Q8VHC5 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Cabp4Q8VHC5 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Cabp4Q8VHC5 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cabp4Q8VHC5 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Cabp4Q8VHC5 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cabp4Q8VHC5 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms