Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDB9

Slc6a20a, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3A, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a20aQ8VDB9 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Slc6a20aQ8VDB9 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Slc6a20aQ8VDB9 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Slc6a20aQ8VDB9 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Slc6a20aQ8VDB9 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Slc6a20aQ8VDB9 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Slc6a20aQ8VDB9 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Slc6a20aQ8VDB9 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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