Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCE1

Dnajc28, DnaJ homolog subfamily C member 28, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc28Q8VCE1 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnajc28Q8VCE1 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnajc28Q8VCE1 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnajc28Q8VCE1 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnajc28Q8VCE1 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnajc28Q8VCE1 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnajc28Q8VCE1 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnajc28Q8VCE1 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnajc28Q8VCE1 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnajc28Q8VCE1 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnajc28Q8VCE1 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnajc28Q8VCE1 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnajc28Q8VCE1 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnajc28Q8VCE1 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnajc28Q8VCE1 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnajc28Q8VCE1 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnajc28Q8VCE1 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnajc28Q8VCE1 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnajc28Q8VCE1 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnajc28Q8VCE1 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnajc28Q8VCE1 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnajc28Q8VCE1 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnajc28Q8VCE1 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnajc28Q8VCE1 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnajc28Q8VCE1 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnajc28Q8VCE1 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnajc28Q8VCE1 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnajc28Q8VCE1 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnajc28Q8VCE1 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnajc28Q8VCE1 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnajc28Q8VCE1 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnajc28Q8VCE1 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnajc28Q8VCE1 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnajc28Q8VCE1 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnajc28Q8VCE1 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnajc28Q8VCE1 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnajc28Q8VCE1 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnajc28Q8VCE1 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnajc28Q8VCE1 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnajc28Q8VCE1 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnajc28Q8VCE1 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnajc28Q8VCE1 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnajc28Q8VCE1 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnajc28Q8VCE1 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnajc28Q8VCE1 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnajc28Q8VCE1 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnajc28Q8VCE1 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnajc28Q8VCE1 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnajc28Q8VCE1 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnajc28Q8VCE1 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnajc28Q8VCE1 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnajc28Q8VCE1 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnajc28Q8VCE1 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnajc28Q8VCE1 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnajc28Q8VCE1 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnajc28Q8VCE1 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnajc28Q8VCE1 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnajc28Q8VCE1 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnajc28Q8VCE1 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnajc28Q8VCE1 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnajc28Q8VCE1 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnajc28Q8VCE1 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnajc28Q8VCE1 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnajc28Q8VCE1 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnajc28Q8VCE1 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnajc28Q8VCE1 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnajc28Q8VCE1 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnajc28Q8VCE1 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnajc28Q8VCE1 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnajc28Q8VCE1 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnajc28Q8VCE1 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnajc28Q8VCE1 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnajc28Q8VCE1 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnajc28Q8VCE1 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnajc28Q8VCE1 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnajc28Q8VCE1 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnajc28Q8VCE1 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnajc28Q8VCE1 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnajc28Q8VCE1 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnajc28Q8VCE1 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnajc28Q8VCE1 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnajc28Q8VCE1 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnajc28Q8VCE1 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnajc28Q8VCE1 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnajc28Q8VCE1 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnajc28Q8VCE1 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnajc28Q8VCE1 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnajc28Q8VCE1 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnajc28Q8VCE1 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnajc28Q8VCE1 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnajc28Q8VCE1 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnajc28Q8VCE1 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnajc28Q8VCE1 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnajc28Q8VCE1 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnajc28Q8VCE1 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnajc28Q8VCE1 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnajc28Q8VCE1 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnajc28Q8VCE1 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnajc28Q8VCE1 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnajc28Q8VCE1 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms