Protein–RNA interactions for Protein: Q8K485

Kctd11, BTB/POZ domain-containing protein KCTD11, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kctd11Q8K485 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kctd11Q8K485 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kctd11Q8K485 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kctd11Q8K485 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Kctd11Q8K485 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kctd11Q8K485 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kctd11Q8K485 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kctd11Q8K485 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kctd11Q8K485 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kctd11Q8K485 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Kctd11Q8K485 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Kctd11Q8K485 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kctd11Q8K485 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kctd11Q8K485 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kctd11Q8K485 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kctd11Q8K485 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kctd11Q8K485 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kctd11Q8K485 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kctd11Q8K485 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kctd11Q8K485 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kctd11Q8K485 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kctd11Q8K485 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kctd11Q8K485 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kctd11Q8K485 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kctd11Q8K485 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kctd11Q8K485 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kctd11Q8K485 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kctd11Q8K485 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kctd11Q8K485 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Kctd11Q8K485 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kctd11Q8K485 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kctd11Q8K485 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kctd11Q8K485 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kctd11Q8K485 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kctd11Q8K485 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kctd11Q8K485 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kctd11Q8K485 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kctd11Q8K485 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kctd11Q8K485 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kctd11Q8K485 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kctd11Q8K485 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kctd11Q8K485 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kctd11Q8K485 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Kctd11Q8K485 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kctd11Q8K485 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Kctd11Q8K485 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kctd11Q8K485 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Kctd11Q8K485 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Kctd11Q8K485 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kctd11Q8K485 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kctd11Q8K485 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kctd11Q8K485 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kctd11Q8K485 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kctd11Q8K485 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kctd11Q8K485 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kctd11Q8K485 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kctd11Q8K485 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kctd11Q8K485 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kctd11Q8K485 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kctd11Q8K485 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kctd11Q8K485 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kctd11Q8K485 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kctd11Q8K485 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kctd11Q8K485 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kctd11Q8K485 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kctd11Q8K485 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kctd11Q8K485 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kctd11Q8K485 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kctd11Q8K485 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Kctd11Q8K485 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Kctd11Q8K485 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Kctd11Q8K485 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Kctd11Q8K485 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Kctd11Q8K485 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Kctd11Q8K485 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Kctd11Q8K485 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Kctd11Q8K485 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Kctd11Q8K485 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Kctd11Q8K485 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Kctd11Q8K485 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Kctd11Q8K485 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Kctd11Q8K485 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Kctd11Q8K485 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Kctd11Q8K485 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Kctd11Q8K485 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Kctd11Q8K485 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Kctd11Q8K485 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Kctd11Q8K485 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Kctd11Q8K485 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Kctd11Q8K485 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Kctd11Q8K485 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Kctd11Q8K485 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Kctd11Q8K485 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Kctd11Q8K485 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Kctd11Q8K485 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Kctd11Q8K485 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Kctd11Q8K485 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Kctd11Q8K485 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Kctd11Q8K485 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Kctd11Q8K485 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms