Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Trappc12Q8K2L8 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Trappc12Q8K2L8 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trappc12Q8K2L8 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trappc12Q8K2L8 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trappc12Q8K2L8 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trappc12Q8K2L8 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trappc12Q8K2L8 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trappc12Q8K2L8 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trappc12Q8K2L8 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc12Q8K2L8 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc12Q8K2L8 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc12Q8K2L8 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc12Q8K2L8 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc12Q8K2L8 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc12Q8K2L8 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Trappc12Q8K2L8 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Trappc12Q8K2L8 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc12Q8K2L8 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Trappc12Q8K2L8 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc12Q8K2L8 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Trappc12Q8K2L8 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc12Q8K2L8 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc12Q8K2L8 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc12Q8K2L8 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc12Q8K2L8 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Trappc12Q8K2L8 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Trappc12Q8K2L8 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc12Q8K2L8 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc12Q8K2L8 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc12Q8K2L8 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc12Q8K2L8 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Trappc12Q8K2L8 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc12Q8K2L8 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Trappc12Q8K2L8 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc12Q8K2L8 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc12Q8K2L8 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc12Q8K2L8 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc12Q8K2L8 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms