Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1R7

Nek9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, mousemouse

Predictions only

Length 984 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek9Q8K1R7 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nek9Q8K1R7 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nek9Q8K1R7 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nek9Q8K1R7 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nek9Q8K1R7 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nek9Q8K1R7 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nek9Q8K1R7 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Nek9Q8K1R7 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nek9Q8K1R7 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nek9Q8K1R7 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nek9Q8K1R7 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nek9Q8K1R7 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nek9Q8K1R7 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nek9Q8K1R7 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nek9Q8K1R7 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nek9Q8K1R7 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nek9Q8K1R7 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nek9Q8K1R7 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nek9Q8K1R7 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Nek9Q8K1R7 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nek9Q8K1R7 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nek9Q8K1R7 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nek9Q8K1R7 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nek9Q8K1R7 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Nek9Q8K1R7 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nek9Q8K1R7 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nek9Q8K1R7 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nek9Q8K1R7 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nek9Q8K1R7 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nek9Q8K1R7 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nek9Q8K1R7 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nek9Q8K1R7 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nek9Q8K1R7 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nek9Q8K1R7 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nek9Q8K1R7 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms