Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1J5

Sde2, Replication stress response regulator SDE2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sde2Q8K1J5 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sde2Q8K1J5 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sde2Q8K1J5 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sde2Q8K1J5 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Sde2Q8K1J5 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sde2Q8K1J5 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sde2Q8K1J5 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sde2Q8K1J5 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sde2Q8K1J5 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sde2Q8K1J5 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sde2Q8K1J5 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sde2Q8K1J5 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sde2Q8K1J5 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sde2Q8K1J5 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Sde2Q8K1J5 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Sde2Q8K1J5 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Sde2Q8K1J5 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sde2Q8K1J5 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sde2Q8K1J5 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sde2Q8K1J5 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sde2Q8K1J5 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Sde2Q8K1J5 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sde2Q8K1J5 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sde2Q8K1J5 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Sde2Q8K1J5 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Sde2Q8K1J5 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sde2Q8K1J5 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sde2Q8K1J5 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sde2Q8K1J5 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Sde2Q8K1J5 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sde2Q8K1J5 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sde2Q8K1J5 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sde2Q8K1J5 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sde2Q8K1J5 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Sde2Q8K1J5 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sde2Q8K1J5 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sde2Q8K1J5 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sde2Q8K1J5 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sde2Q8K1J5 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sde2Q8K1J5 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sde2Q8K1J5 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sde2Q8K1J5 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sde2Q8K1J5 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sde2Q8K1J5 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sde2Q8K1J5 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sde2Q8K1J5 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sde2Q8K1J5 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sde2Q8K1J5 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Sde2Q8K1J5 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sde2Q8K1J5 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Sde2Q8K1J5 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sde2Q8K1J5 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Sde2Q8K1J5 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sde2Q8K1J5 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Sde2Q8K1J5 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sde2Q8K1J5 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sde2Q8K1J5 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sde2Q8K1J5 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sde2Q8K1J5 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sde2Q8K1J5 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sde2Q8K1J5 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sde2Q8K1J5 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sde2Q8K1J5 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sde2Q8K1J5 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Sde2Q8K1J5 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sde2Q8K1J5 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sde2Q8K1J5 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sde2Q8K1J5 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sde2Q8K1J5 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sde2Q8K1J5 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sde2Q8K1J5 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sde2Q8K1J5 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sde2Q8K1J5 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sde2Q8K1J5 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sde2Q8K1J5 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sde2Q8K1J5 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sde2Q8K1J5 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sde2Q8K1J5 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Sde2Q8K1J5 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sde2Q8K1J5 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sde2Q8K1J5 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sde2Q8K1J5 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sde2Q8K1J5 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sde2Q8K1J5 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sde2Q8K1J5 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sde2Q8K1J5 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Sde2Q8K1J5 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Sde2Q8K1J5 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Sde2Q8K1J5 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sde2Q8K1J5 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sde2Q8K1J5 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sde2Q8K1J5 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sde2Q8K1J5 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sde2Q8K1J5 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sde2Q8K1J5 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sde2Q8K1J5 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sde2Q8K1J5 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sde2Q8K1J5 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sde2Q8K1J5 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Sde2Q8K1J5 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms