Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZL7

Rasgef1b, Ras-GEF domain-containing family member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasgef1bQ8JZL7 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rasgef1bQ8JZL7 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rasgef1bQ8JZL7 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rasgef1bQ8JZL7 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rasgef1bQ8JZL7 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rasgef1bQ8JZL7 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rasgef1bQ8JZL7 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rasgef1bQ8JZL7 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Rasgef1bQ8JZL7 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rasgef1bQ8JZL7 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Rasgef1bQ8JZL7 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Rasgef1bQ8JZL7 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Rasgef1bQ8JZL7 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Rasgef1bQ8JZL7 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Rasgef1bQ8JZL7 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rasgef1bQ8JZL7 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rasgef1bQ8JZL7 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Rasgef1bQ8JZL7 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rasgef1bQ8JZL7 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Rasgef1bQ8JZL7 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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Rasgef1bQ8JZL7 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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Rasgef1bQ8JZL7 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rasgef1bQ8JZL7 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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Rasgef1bQ8JZL7 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rasgef1bQ8JZL7 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rasgef1bQ8JZL7 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rasgef1bQ8JZL7 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rasgef1bQ8JZL7 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
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Rasgef1bQ8JZL7 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rasgef1bQ8JZL7 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Rasgef1bQ8JZL7 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Rasgef1bQ8JZL7 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Rasgef1bQ8JZL7 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rasgef1bQ8JZL7 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Rasgef1bQ8JZL7 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Rasgef1bQ8JZL7 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rasgef1bQ8JZL7 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Rasgef1bQ8JZL7 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rasgef1bQ8JZL7 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rasgef1bQ8JZL7 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rasgef1bQ8JZL7 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rasgef1bQ8JZL7 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rasgef1bQ8JZL7 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rasgef1bQ8JZL7 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
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Rasgef1bQ8JZL7 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms