Protein–RNA interactions for Protein: Q8CH19

Csnka2ip, Casein kinase II subunit alpha'-interacting protein, mousemouse

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Length 720 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnka2ipQ8CH19 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Csnka2ipQ8CH19 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
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Csnka2ipQ8CH19 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csnka2ipQ8CH19 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.9 ms