Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hpf1Q8CFE2 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hpf1Q8CFE2 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hpf1Q8CFE2 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hpf1Q8CFE2 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hpf1Q8CFE2 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Hpf1Q8CFE2 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Hpf1Q8CFE2 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hpf1Q8CFE2 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hpf1Q8CFE2 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Hpf1Q8CFE2 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hpf1Q8CFE2 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Hpf1Q8CFE2 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Hpf1Q8CFE2 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Hpf1Q8CFE2 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hpf1Q8CFE2 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hpf1Q8CFE2 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hpf1Q8CFE2 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hpf1Q8CFE2 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hpf1Q8CFE2 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hpf1Q8CFE2 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hpf1Q8CFE2 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hpf1Q8CFE2 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hpf1Q8CFE2 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hpf1Q8CFE2 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hpf1Q8CFE2 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hpf1Q8CFE2 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hpf1Q8CFE2 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hpf1Q8CFE2 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hpf1Q8CFE2 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hpf1Q8CFE2 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hpf1Q8CFE2 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hpf1Q8CFE2 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hpf1Q8CFE2 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Hpf1Q8CFE2 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hpf1Q8CFE2 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hpf1Q8CFE2 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hpf1Q8CFE2 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hpf1Q8CFE2 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hpf1Q8CFE2 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hpf1Q8CFE2 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hpf1Q8CFE2 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hpf1Q8CFE2 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hpf1Q8CFE2 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hpf1Q8CFE2 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
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Hpf1Q8CFE2 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Hpf1Q8CFE2 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hpf1Q8CFE2 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hpf1Q8CFE2 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hpf1Q8CFE2 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hpf1Q8CFE2 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Hpf1Q8CFE2 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Hpf1Q8CFE2 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Hpf1Q8CFE2 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Hpf1Q8CFE2 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hpf1Q8CFE2 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hpf1Q8CFE2 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hpf1Q8CFE2 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Hpf1Q8CFE2 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hpf1Q8CFE2 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Hpf1Q8CFE2 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Hpf1Q8CFE2 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hpf1Q8CFE2 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Hpf1Q8CFE2 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hpf1Q8CFE2 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hpf1Q8CFE2 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.7 ms