Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFA2

Amt, Aminomethyltransferase, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmtQ8CFA2 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
AmtQ8CFA2 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
AmtQ8CFA2 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
AmtQ8CFA2 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
AmtQ8CFA2 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
AmtQ8CFA2 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
AmtQ8CFA2 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
AmtQ8CFA2 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
AmtQ8CFA2 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
AmtQ8CFA2 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
AmtQ8CFA2 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
AmtQ8CFA2 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
AmtQ8CFA2 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
AmtQ8CFA2 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
AmtQ8CFA2 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
AmtQ8CFA2 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
AmtQ8CFA2 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
AmtQ8CFA2 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
AmtQ8CFA2 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
AmtQ8CFA2 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
AmtQ8CFA2 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
AmtQ8CFA2 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
AmtQ8CFA2 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
AmtQ8CFA2 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
AmtQ8CFA2 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
AmtQ8CFA2 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
AmtQ8CFA2 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
AmtQ8CFA2 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
AmtQ8CFA2 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
AmtQ8CFA2 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
AmtQ8CFA2 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
AmtQ8CFA2 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
AmtQ8CFA2 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
AmtQ8CFA2 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
AmtQ8CFA2 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
AmtQ8CFA2 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
AmtQ8CFA2 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
AmtQ8CFA2 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
AmtQ8CFA2 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
AmtQ8CFA2 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
AmtQ8CFA2 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
AmtQ8CFA2 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
AmtQ8CFA2 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
AmtQ8CFA2 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
AmtQ8CFA2 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
AmtQ8CFA2 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
AmtQ8CFA2 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
AmtQ8CFA2 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
AmtQ8CFA2 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
AmtQ8CFA2 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
AmtQ8CFA2 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
AmtQ8CFA2 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
AmtQ8CFA2 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
AmtQ8CFA2 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
AmtQ8CFA2 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
AmtQ8CFA2 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
AmtQ8CFA2 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
AmtQ8CFA2 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
AmtQ8CFA2 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
AmtQ8CFA2 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
AmtQ8CFA2 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
AmtQ8CFA2 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
AmtQ8CFA2 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
AmtQ8CFA2 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
AmtQ8CFA2 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
AmtQ8CFA2 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
AmtQ8CFA2 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
AmtQ8CFA2 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
AmtQ8CFA2 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
AmtQ8CFA2 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
AmtQ8CFA2 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
AmtQ8CFA2 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
AmtQ8CFA2 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
AmtQ8CFA2 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
AmtQ8CFA2 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
AmtQ8CFA2 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
AmtQ8CFA2 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
AmtQ8CFA2 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
AmtQ8CFA2 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
AmtQ8CFA2 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
AmtQ8CFA2 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
AmtQ8CFA2 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
AmtQ8CFA2 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
AmtQ8CFA2 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
AmtQ8CFA2 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
AmtQ8CFA2 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
AmtQ8CFA2 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
AmtQ8CFA2 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
AmtQ8CFA2 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
AmtQ8CFA2 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
AmtQ8CFA2 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
AmtQ8CFA2 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
AmtQ8CFA2 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
AmtQ8CFA2 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
AmtQ8CFA2 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
AmtQ8CFA2 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
AmtQ8CFA2 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
AmtQ8CFA2 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
AmtQ8CFA2 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
AmtQ8CFA2 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms