Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN8

Ccdc38, Coiled-coil domain-containing protein 38, mousemouse

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Length 563 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc38Q8CDN8 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc38Q8CDN8 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc38Q8CDN8 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc38Q8CDN8 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc38Q8CDN8 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc38Q8CDN8 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc38Q8CDN8 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc38Q8CDN8 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc38Q8CDN8 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc38Q8CDN8 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc38Q8CDN8 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc38Q8CDN8 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc38Q8CDN8 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc38Q8CDN8 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc38Q8CDN8 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc38Q8CDN8 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc38Q8CDN8 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc38Q8CDN8 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc38Q8CDN8 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc38Q8CDN8 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc38Q8CDN8 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc38Q8CDN8 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc38Q8CDN8 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc38Q8CDN8 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc38Q8CDN8 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc38Q8CDN8 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc38Q8CDN8 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc38Q8CDN8 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc38Q8CDN8 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc38Q8CDN8 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc38Q8CDN8 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc38Q8CDN8 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc38Q8CDN8 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc38Q8CDN8 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc38Q8CDN8 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc38Q8CDN8 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc38Q8CDN8 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc38Q8CDN8 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc38Q8CDN8 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc38Q8CDN8 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc38Q8CDN8 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc38Q8CDN8 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc38Q8CDN8 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc38Q8CDN8 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc38Q8CDN8 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc38Q8CDN8 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc38Q8CDN8 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc38Q8CDN8 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc38Q8CDN8 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc38Q8CDN8 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc38Q8CDN8 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc38Q8CDN8 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc38Q8CDN8 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc38Q8CDN8 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc38Q8CDN8 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc38Q8CDN8 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc38Q8CDN8 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc38Q8CDN8 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc38Q8CDN8 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc38Q8CDN8 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc38Q8CDN8 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc38Q8CDN8 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc38Q8CDN8 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc38Q8CDN8 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc38Q8CDN8 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc38Q8CDN8 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc38Q8CDN8 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc38Q8CDN8 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc38Q8CDN8 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc38Q8CDN8 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc38Q8CDN8 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc38Q8CDN8 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc38Q8CDN8 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc38Q8CDN8 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc38Q8CDN8 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc38Q8CDN8 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc38Q8CDN8 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc38Q8CDN8 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc38Q8CDN8 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc38Q8CDN8 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc38Q8CDN8 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc38Q8CDN8 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc38Q8CDN8 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc38Q8CDN8 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc38Q8CDN8 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc38Q8CDN8 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc38Q8CDN8 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc38Q8CDN8 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc38Q8CDN8 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc38Q8CDN8 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc38Q8CDN8 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc38Q8CDN8 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc38Q8CDN8 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc38Q8CDN8 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc38Q8CDN8 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc38Q8CDN8 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc38Q8CDN8 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc38Q8CDN8 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc38Q8CDN8 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc38Q8CDN8 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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