Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atg4aQ8C9S8 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atg4aQ8C9S8 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atg4aQ8C9S8 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atg4aQ8C9S8 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atg4aQ8C9S8 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atg4aQ8C9S8 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Atg4aQ8C9S8 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atg4aQ8C9S8 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atg4aQ8C9S8 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Atg4aQ8C9S8 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atg4aQ8C9S8 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atg4aQ8C9S8 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atg4aQ8C9S8 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atg4aQ8C9S8 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atg4aQ8C9S8 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atg4aQ8C9S8 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atg4aQ8C9S8 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atg4aQ8C9S8 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atg4aQ8C9S8 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atg4aQ8C9S8 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atg4aQ8C9S8 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atg4aQ8C9S8 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Atg4aQ8C9S8 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atg4aQ8C9S8 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atg4aQ8C9S8 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atg4aQ8C9S8 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atg4aQ8C9S8 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atg4aQ8C9S8 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atg4aQ8C9S8 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atg4aQ8C9S8 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atg4aQ8C9S8 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atg4aQ8C9S8 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atg4aQ8C9S8 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atg4aQ8C9S8 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atg4aQ8C9S8 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atg4aQ8C9S8 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atg4aQ8C9S8 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atg4aQ8C9S8 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atg4aQ8C9S8 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atg4aQ8C9S8 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atg4aQ8C9S8 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Atg4aQ8C9S8 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atg4aQ8C9S8 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atg4aQ8C9S8 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atg4aQ8C9S8 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atg4aQ8C9S8 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atg4aQ8C9S8 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atg4aQ8C9S8 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atg4aQ8C9S8 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atg4aQ8C9S8 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atg4aQ8C9S8 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atg4aQ8C9S8 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atg4aQ8C9S8 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atg4aQ8C9S8 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Atg4aQ8C9S8 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atg4aQ8C9S8 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atg4aQ8C9S8 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Atg4aQ8C9S8 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atg4aQ8C9S8 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atg4aQ8C9S8 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Atg4aQ8C9S8 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atg4aQ8C9S8 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atg4aQ8C9S8 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atg4aQ8C9S8 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atg4aQ8C9S8 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Atg4aQ8C9S8 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atg4aQ8C9S8 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Atg4aQ8C9S8 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atg4aQ8C9S8 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atg4aQ8C9S8 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atg4aQ8C9S8 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atg4aQ8C9S8 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atg4aQ8C9S8 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atg4aQ8C9S8 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atg4aQ8C9S8 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atg4aQ8C9S8 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atg4aQ8C9S8 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Atg4aQ8C9S8 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Atg4aQ8C9S8 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Atg4aQ8C9S8 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atg4aQ8C9S8 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atg4aQ8C9S8 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atg4aQ8C9S8 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atg4aQ8C9S8 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atg4aQ8C9S8 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Atg4aQ8C9S8 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atg4aQ8C9S8 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atg4aQ8C9S8 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atg4aQ8C9S8 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atg4aQ8C9S8 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atg4aQ8C9S8 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atg4aQ8C9S8 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atg4aQ8C9S8 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atg4aQ8C9S8 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atg4aQ8C9S8 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atg4aQ8C9S8 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atg4aQ8C9S8 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atg4aQ8C9S8 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atg4aQ8C9S8 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms