Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

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Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Usp38Q8BW70 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp38Q8BW70 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Usp38Q8BW70 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp38Q8BW70 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Usp38Q8BW70 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Usp38Q8BW70 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Usp38Q8BW70 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Usp38Q8BW70 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Usp38Q8BW70 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp38Q8BW70 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp38Q8BW70 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp38Q8BW70 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp38Q8BW70 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Usp38Q8BW70 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp38Q8BW70 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp38Q8BW70 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp38Q8BW70 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp38Q8BW70 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp38Q8BW70 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp38Q8BW70 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp38Q8BW70 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp38Q8BW70 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp38Q8BW70 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp38Q8BW70 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp38Q8BW70 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp38Q8BW70 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp38Q8BW70 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms