Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKU8

Tmem87b, Transmembrane protein 87B, mousemouse

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem87bQ8BKU8 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmem87bQ8BKU8 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmem87bQ8BKU8 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmem87bQ8BKU8 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmem87bQ8BKU8 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmem87bQ8BKU8 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmem87bQ8BKU8 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmem87bQ8BKU8 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmem87bQ8BKU8 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmem87bQ8BKU8 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmem87bQ8BKU8 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmem87bQ8BKU8 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmem87bQ8BKU8 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmem87bQ8BKU8 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmem87bQ8BKU8 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmem87bQ8BKU8 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmem87bQ8BKU8 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmem87bQ8BKU8 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmem87bQ8BKU8 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmem87bQ8BKU8 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmem87bQ8BKU8 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmem87bQ8BKU8 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmem87bQ8BKU8 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmem87bQ8BKU8 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmem87bQ8BKU8 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmem87bQ8BKU8 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmem87bQ8BKU8 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmem87bQ8BKU8 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmem87bQ8BKU8 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmem87bQ8BKU8 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmem87bQ8BKU8 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmem87bQ8BKU8 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmem87bQ8BKU8 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmem87bQ8BKU8 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmem87bQ8BKU8 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmem87bQ8BKU8 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmem87bQ8BKU8 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmem87bQ8BKU8 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmem87bQ8BKU8 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmem87bQ8BKU8 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmem87bQ8BKU8 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmem87bQ8BKU8 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmem87bQ8BKU8 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmem87bQ8BKU8 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmem87bQ8BKU8 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmem87bQ8BKU8 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmem87bQ8BKU8 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmem87bQ8BKU8 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmem87bQ8BKU8 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmem87bQ8BKU8 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmem87bQ8BKU8 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmem87bQ8BKU8 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmem87bQ8BKU8 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmem87bQ8BKU8 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmem87bQ8BKU8 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmem87bQ8BKU8 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmem87bQ8BKU8 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmem87bQ8BKU8 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmem87bQ8BKU8 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmem87bQ8BKU8 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmem87bQ8BKU8 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmem87bQ8BKU8 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmem87bQ8BKU8 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmem87bQ8BKU8 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmem87bQ8BKU8 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmem87bQ8BKU8 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmem87bQ8BKU8 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmem87bQ8BKU8 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmem87bQ8BKU8 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmem87bQ8BKU8 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmem87bQ8BKU8 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmem87bQ8BKU8 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmem87bQ8BKU8 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmem87bQ8BKU8 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmem87bQ8BKU8 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmem87bQ8BKU8 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmem87bQ8BKU8 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmem87bQ8BKU8 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmem87bQ8BKU8 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmem87bQ8BKU8 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmem87bQ8BKU8 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmem87bQ8BKU8 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmem87bQ8BKU8 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmem87bQ8BKU8 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmem87bQ8BKU8 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmem87bQ8BKU8 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmem87bQ8BKU8 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmem87bQ8BKU8 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmem87bQ8BKU8 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmem87bQ8BKU8 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmem87bQ8BKU8 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmem87bQ8BKU8 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmem87bQ8BKU8 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmem87bQ8BKU8 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmem87bQ8BKU8 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmem87bQ8BKU8 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmem87bQ8BKU8 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmem87bQ8BKU8 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmem87bQ8BKU8 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmem87bQ8BKU8 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms