Protein–RNA interactions for Protein: Q80XK6

Atg2b, Autophagy-related protein 2 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 2,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2bQ80XK6 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg2bQ80XK6 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg2bQ80XK6 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg2bQ80XK6 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg2bQ80XK6 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg2bQ80XK6 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg2bQ80XK6 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg2bQ80XK6 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg2bQ80XK6 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg2bQ80XK6 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg2bQ80XK6 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg2bQ80XK6 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg2bQ80XK6 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg2bQ80XK6 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg2bQ80XK6 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg2bQ80XK6 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg2bQ80XK6 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg2bQ80XK6 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg2bQ80XK6 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg2bQ80XK6 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg2bQ80XK6 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg2bQ80XK6 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg2bQ80XK6 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg2bQ80XK6 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg2bQ80XK6 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg2bQ80XK6 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg2bQ80XK6 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg2bQ80XK6 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg2bQ80XK6 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg2bQ80XK6 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg2bQ80XK6 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg2bQ80XK6 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg2bQ80XK6 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg2bQ80XK6 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg2bQ80XK6 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg2bQ80XK6 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg2bQ80XK6 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg2bQ80XK6 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg2bQ80XK6 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg2bQ80XK6 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg2bQ80XK6 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg2bQ80XK6 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg2bQ80XK6 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg2bQ80XK6 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg2bQ80XK6 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg2bQ80XK6 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg2bQ80XK6 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg2bQ80XK6 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg2bQ80XK6 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg2bQ80XK6 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg2bQ80XK6 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg2bQ80XK6 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg2bQ80XK6 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg2bQ80XK6 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg2bQ80XK6 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg2bQ80XK6 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg2bQ80XK6 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg2bQ80XK6 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg2bQ80XK6 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg2bQ80XK6 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg2bQ80XK6 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg2bQ80XK6 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg2bQ80XK6 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg2bQ80XK6 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg2bQ80XK6 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg2bQ80XK6 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg2bQ80XK6 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg2bQ80XK6 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg2bQ80XK6 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg2bQ80XK6 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg2bQ80XK6 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg2bQ80XK6 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg2bQ80XK6 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg2bQ80XK6 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg2bQ80XK6 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg2bQ80XK6 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg2bQ80XK6 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg2bQ80XK6 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg2bQ80XK6 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg2bQ80XK6 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg2bQ80XK6 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg2bQ80XK6 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg2bQ80XK6 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg2bQ80XK6 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg2bQ80XK6 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Atg2bQ80XK6 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Atg2bQ80XK6 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Atg2bQ80XK6 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Atg2bQ80XK6 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Atg2bQ80XK6 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Atg2bQ80XK6 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Atg2bQ80XK6 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
Atg2bQ80XK6 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Atg2bQ80XK6 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Atg2bQ80XK6 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
Atg2bQ80XK6 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Atg2bQ80XK6 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Atg2bQ80XK6 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Atg2bQ80XK6 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
Atg2bQ80XK6 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms