Protein–RNA interactions for Protein: Q80U56

Avl9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, mousemouse

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Avl9Q80U56 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Avl9Q80U56 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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