Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH7

Kcnf1, Potassium voltage-gated channel subfamily F member 1, mousemouse

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnf1Q7TSH7 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnf1Q7TSH7 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnf1Q7TSH7 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnf1Q7TSH7 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnf1Q7TSH7 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnf1Q7TSH7 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnf1Q7TSH7 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnf1Q7TSH7 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnf1Q7TSH7 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnf1Q7TSH7 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnf1Q7TSH7 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnf1Q7TSH7 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnf1Q7TSH7 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnf1Q7TSH7 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnf1Q7TSH7 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnf1Q7TSH7 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnf1Q7TSH7 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnf1Q7TSH7 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnf1Q7TSH7 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnf1Q7TSH7 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnf1Q7TSH7 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnf1Q7TSH7 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnf1Q7TSH7 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnf1Q7TSH7 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnf1Q7TSH7 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnf1Q7TSH7 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnf1Q7TSH7 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnf1Q7TSH7 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnf1Q7TSH7 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnf1Q7TSH7 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnf1Q7TSH7 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnf1Q7TSH7 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnf1Q7TSH7 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnf1Q7TSH7 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnf1Q7TSH7 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnf1Q7TSH7 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnf1Q7TSH7 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnf1Q7TSH7 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnf1Q7TSH7 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnf1Q7TSH7 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnf1Q7TSH7 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnf1Q7TSH7 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnf1Q7TSH7 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnf1Q7TSH7 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnf1Q7TSH7 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnf1Q7TSH7 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnf1Q7TSH7 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnf1Q7TSH7 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnf1Q7TSH7 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnf1Q7TSH7 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnf1Q7TSH7 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnf1Q7TSH7 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnf1Q7TSH7 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnf1Q7TSH7 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnf1Q7TSH7 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnf1Q7TSH7 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnf1Q7TSH7 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnf1Q7TSH7 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnf1Q7TSH7 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnf1Q7TSH7 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnf1Q7TSH7 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnf1Q7TSH7 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnf1Q7TSH7 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnf1Q7TSH7 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnf1Q7TSH7 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnf1Q7TSH7 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnf1Q7TSH7 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnf1Q7TSH7 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.02
Kcnf1Q7TSH7 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcnf1Q7TSH7 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcnf1Q7TSH7 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcnf1Q7TSH7 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcnf1Q7TSH7 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcnf1Q7TSH7 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcnf1Q7TSH7 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcnf1Q7TSH7 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcnf1Q7TSH7 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcnf1Q7TSH7 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcnf1Q7TSH7 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcnf1Q7TSH7 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcnf1Q7TSH7 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcnf1Q7TSH7 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcnf1Q7TSH7 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcnf1Q7TSH7 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcnf1Q7TSH7 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcnf1Q7TSH7 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcnf1Q7TSH7 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcnf1Q7TSH7 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcnf1Q7TSH7 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcnf1Q7TSH7 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcnf1Q7TSH7 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcnf1Q7TSH7 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcnf1Q7TSH7 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcnf1Q7TSH7 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcnf1Q7TSH7 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcnf1Q7TSH7 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcnf1Q7TSH7 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcnf1Q7TSH7 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcnf1Q7TSH7 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcnf1Q7TSH7 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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