Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Actn1Q7TPR4 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Actn1Q7TPR4 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Actn1Q7TPR4 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Actn1Q7TPR4 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Actn1Q7TPR4 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Actn1Q7TPR4 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Actn1Q7TPR4 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Actn1Q7TPR4 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Actn1Q7TPR4 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Actn1Q7TPR4 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Actn1Q7TPR4 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Actn1Q7TPR4 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Actn1Q7TPR4 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Actn1Q7TPR4 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Actn1Q7TPR4 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Actn1Q7TPR4 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Actn1Q7TPR4 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Actn1Q7TPR4 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Actn1Q7TPR4 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Actn1Q7TPR4 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Actn1Q7TPR4 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Actn1Q7TPR4 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Actn1Q7TPR4 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Actn1Q7TPR4 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Actn1Q7TPR4 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Actn1Q7TPR4 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Actn1Q7TPR4 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Actn1Q7TPR4 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Actn1Q7TPR4 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Actn1Q7TPR4 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Actn1Q7TPR4 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Actn1Q7TPR4 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Actn1Q7TPR4 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Actn1Q7TPR4 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Actn1Q7TPR4 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Actn1Q7TPR4 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Actn1Q7TPR4 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Actn1Q7TPR4 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Actn1Q7TPR4 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Actn1Q7TPR4 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Actn1Q7TPR4 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Actn1Q7TPR4 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Actn1Q7TPR4 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Actn1Q7TPR4 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Actn1Q7TPR4 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Actn1Q7TPR4 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Actn1Q7TPR4 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Actn1Q7TPR4 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Actn1Q7TPR4 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Actn1Q7TPR4 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Actn1Q7TPR4 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Actn1Q7TPR4 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Actn1Q7TPR4 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Actn1Q7TPR4 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Actn1Q7TPR4 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Actn1Q7TPR4 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Actn1Q7TPR4 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Actn1Q7TPR4 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Actn1Q7TPR4 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Actn1Q7TPR4 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Actn1Q7TPR4 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Actn1Q7TPR4 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Actn1Q7TPR4 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Actn1Q7TPR4 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Actn1Q7TPR4 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Actn1Q7TPR4 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Actn1Q7TPR4 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Actn1Q7TPR4 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Actn1Q7TPR4 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Actn1Q7TPR4 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Actn1Q7TPR4 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Actn1Q7TPR4 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Actn1Q7TPR4 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Actn1Q7TPR4 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Actn1Q7TPR4 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Actn1Q7TPR4 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Actn1Q7TPR4 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Actn1Q7TPR4 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Actn1Q7TPR4 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms