Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CtifQ6PEE2 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
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