Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDI5

Ecm29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,840 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm29Q6PDI5 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ecm29Q6PDI5 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ecm29Q6PDI5 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ecm29Q6PDI5 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ecm29Q6PDI5 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ecm29Q6PDI5 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ecm29Q6PDI5 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ecm29Q6PDI5 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ecm29Q6PDI5 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ecm29Q6PDI5 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ecm29Q6PDI5 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ecm29Q6PDI5 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ecm29Q6PDI5 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ecm29Q6PDI5 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ecm29Q6PDI5 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ecm29Q6PDI5 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ecm29Q6PDI5 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ecm29Q6PDI5 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ecm29Q6PDI5 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ecm29Q6PDI5 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ecm29Q6PDI5 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ecm29Q6PDI5 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ecm29Q6PDI5 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ecm29Q6PDI5 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ecm29Q6PDI5 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ecm29Q6PDI5 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ecm29Q6PDI5 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ecm29Q6PDI5 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ecm29Q6PDI5 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ecm29Q6PDI5 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ecm29Q6PDI5 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ecm29Q6PDI5 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ecm29Q6PDI5 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ecm29Q6PDI5 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ecm29Q6PDI5 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ecm29Q6PDI5 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ecm29Q6PDI5 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ecm29Q6PDI5 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ecm29Q6PDI5 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ecm29Q6PDI5 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ecm29Q6PDI5 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ecm29Q6PDI5 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ecm29Q6PDI5 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ecm29Q6PDI5 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ecm29Q6PDI5 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ecm29Q6PDI5 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ecm29Q6PDI5 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ecm29Q6PDI5 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ecm29Q6PDI5 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ecm29Q6PDI5 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ecm29Q6PDI5 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ecm29Q6PDI5 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ecm29Q6PDI5 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ecm29Q6PDI5 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ecm29Q6PDI5 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ecm29Q6PDI5 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ecm29Q6PDI5 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ecm29Q6PDI5 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ecm29Q6PDI5 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ecm29Q6PDI5 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ecm29Q6PDI5 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ecm29Q6PDI5 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Ecm29Q6PDI5 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ecm29Q6PDI5 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ecm29Q6PDI5 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Ecm29Q6PDI5 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ecm29Q6PDI5 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ecm29Q6PDI5 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ecm29Q6PDI5 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ecm29Q6PDI5 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ecm29Q6PDI5 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ecm29Q6PDI5 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ecm29Q6PDI5 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ecm29Q6PDI5 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ecm29Q6PDI5 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ecm29Q6PDI5 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ecm29Q6PDI5 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ecm29Q6PDI5 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ecm29Q6PDI5 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ecm29Q6PDI5 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ecm29Q6PDI5 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ecm29Q6PDI5 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ecm29Q6PDI5 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ecm29Q6PDI5 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ecm29Q6PDI5 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ecm29Q6PDI5 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ecm29Q6PDI5 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ecm29Q6PDI5 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ecm29Q6PDI5 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ecm29Q6PDI5 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ecm29Q6PDI5 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ecm29Q6PDI5 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ecm29Q6PDI5 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ecm29Q6PDI5 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ecm29Q6PDI5 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ecm29Q6PDI5 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ecm29Q6PDI5 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ecm29Q6PDI5 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ecm29Q6PDI5 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ecm29Q6PDI5 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.4 ms