Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW5

Atp11b, Phospholipid-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp11bQ6DFW5 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atp11bQ6DFW5 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atp11bQ6DFW5 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atp11bQ6DFW5 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atp11bQ6DFW5 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atp11bQ6DFW5 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atp11bQ6DFW5 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atp11bQ6DFW5 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atp11bQ6DFW5 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atp11bQ6DFW5 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atp11bQ6DFW5 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atp11bQ6DFW5 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atp11bQ6DFW5 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp11bQ6DFW5 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp11bQ6DFW5 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp11bQ6DFW5 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp11bQ6DFW5 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp11bQ6DFW5 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp11bQ6DFW5 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp11bQ6DFW5 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp11bQ6DFW5 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp11bQ6DFW5 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp11bQ6DFW5 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp11bQ6DFW5 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp11bQ6DFW5 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp11bQ6DFW5 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp11bQ6DFW5 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp11bQ6DFW5 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp11bQ6DFW5 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp11bQ6DFW5 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp11bQ6DFW5 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp11bQ6DFW5 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp11bQ6DFW5 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp11bQ6DFW5 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp11bQ6DFW5 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp11bQ6DFW5 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp11bQ6DFW5 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp11bQ6DFW5 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp11bQ6DFW5 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp11bQ6DFW5 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp11bQ6DFW5 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp11bQ6DFW5 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp11bQ6DFW5 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp11bQ6DFW5 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp11bQ6DFW5 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp11bQ6DFW5 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp11bQ6DFW5 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp11bQ6DFW5 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp11bQ6DFW5 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atp11bQ6DFW5 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atp11bQ6DFW5 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atp11bQ6DFW5 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atp11bQ6DFW5 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atp11bQ6DFW5 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atp11bQ6DFW5 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atp11bQ6DFW5 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atp11bQ6DFW5 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atp11bQ6DFW5 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atp11bQ6DFW5 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Atp11bQ6DFW5 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atp11bQ6DFW5 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atp11bQ6DFW5 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Atp11bQ6DFW5 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atp11bQ6DFW5 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atp11bQ6DFW5 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atp11bQ6DFW5 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atp11bQ6DFW5 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atp11bQ6DFW5 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atp11bQ6DFW5 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atp11bQ6DFW5 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Atp11bQ6DFW5 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atp11bQ6DFW5 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atp11bQ6DFW5 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atp11bQ6DFW5 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atp11bQ6DFW5 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atp11bQ6DFW5 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atp11bQ6DFW5 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atp11bQ6DFW5 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atp11bQ6DFW5 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atp11bQ6DFW5 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atp11bQ6DFW5 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atp11bQ6DFW5 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atp11bQ6DFW5 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atp11bQ6DFW5 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atp11bQ6DFW5 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atp11bQ6DFW5 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atp11bQ6DFW5 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atp11bQ6DFW5 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Atp11bQ6DFW5 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Atp11bQ6DFW5 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atp11bQ6DFW5 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Atp11bQ6DFW5 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atp11bQ6DFW5 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atp11bQ6DFW5 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atp11bQ6DFW5 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atp11bQ6DFW5 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atp11bQ6DFW5 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atp11bQ6DFW5 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atp11bQ6DFW5 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atp11bQ6DFW5 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms