Protein–RNA interactions for Protein: Q6BCL1

Pram1, PML-RARA-regulated adapter molecule 1, mousemouse

Predictions only

Length 675 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pram1Q6BCL1 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pram1Q6BCL1 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pram1Q6BCL1 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pram1Q6BCL1 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pram1Q6BCL1 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pram1Q6BCL1 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pram1Q6BCL1 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pram1Q6BCL1 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pram1Q6BCL1 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pram1Q6BCL1 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pram1Q6BCL1 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pram1Q6BCL1 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pram1Q6BCL1 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pram1Q6BCL1 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pram1Q6BCL1 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pram1Q6BCL1 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pram1Q6BCL1 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pram1Q6BCL1 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Pram1Q6BCL1 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pram1Q6BCL1 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pram1Q6BCL1 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Pram1Q6BCL1 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pram1Q6BCL1 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pram1Q6BCL1 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pram1Q6BCL1 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pram1Q6BCL1 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pram1Q6BCL1 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pram1Q6BCL1 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pram1Q6BCL1 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pram1Q6BCL1 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pram1Q6BCL1 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pram1Q6BCL1 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Pram1Q6BCL1 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pram1Q6BCL1 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pram1Q6BCL1 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pram1Q6BCL1 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Pram1Q6BCL1 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Pram1Q6BCL1 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pram1Q6BCL1 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pram1Q6BCL1 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pram1Q6BCL1 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pram1Q6BCL1 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pram1Q6BCL1 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pram1Q6BCL1 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pram1Q6BCL1 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pram1Q6BCL1 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pram1Q6BCL1 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pram1Q6BCL1 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pram1Q6BCL1 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pram1Q6BCL1 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pram1Q6BCL1 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pram1Q6BCL1 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pram1Q6BCL1 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Pram1Q6BCL1 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pram1Q6BCL1 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pram1Q6BCL1 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pram1Q6BCL1 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pram1Q6BCL1 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pram1Q6BCL1 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pram1Q6BCL1 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pram1Q6BCL1 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pram1Q6BCL1 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pram1Q6BCL1 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pram1Q6BCL1 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pram1Q6BCL1 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pram1Q6BCL1 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pram1Q6BCL1 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pram1Q6BCL1 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pram1Q6BCL1 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pram1Q6BCL1 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pram1Q6BCL1 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Pram1Q6BCL1 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pram1Q6BCL1 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pram1Q6BCL1 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pram1Q6BCL1 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pram1Q6BCL1 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pram1Q6BCL1 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pram1Q6BCL1 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pram1Q6BCL1 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Pram1Q6BCL1 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pram1Q6BCL1 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pram1Q6BCL1 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pram1Q6BCL1 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pram1Q6BCL1 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Pram1Q6BCL1 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pram1Q6BCL1 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Pram1Q6BCL1 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Pram1Q6BCL1 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Pram1Q6BCL1 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pram1Q6BCL1 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pram1Q6BCL1 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pram1Q6BCL1 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pram1Q6BCL1 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pram1Q6BCL1 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pram1Q6BCL1 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pram1Q6BCL1 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pram1Q6BCL1 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pram1Q6BCL1 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pram1Q6BCL1 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pram1Q6BCL1 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms