Protein–RNA interactions for Protein: Q64127

Trim24, Transcription intermediary factor 1-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim24Q64127 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms