Protein–RNA interactions for Protein: Q63871

Polr2k, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4, mousemouse

Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2kQ63871 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms