Protein–RNA interactions for Protein: Q62280

Ss18, Protein SSXT, mousemouse

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18Q62280 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
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Ss18Q62280 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
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Ss18Q62280 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
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