Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms