Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Traf3Q60803 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Traf3Q60803 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Traf3Q60803 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Traf3Q60803 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Traf3Q60803 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Traf3Q60803 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Traf3Q60803 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Traf3Q60803 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Traf3Q60803 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Traf3Q60803 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Traf3Q60803 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Traf3Q60803 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Traf3Q60803 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Traf3Q60803 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Traf3Q60803 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Traf3Q60803 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Traf3Q60803 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Traf3Q60803 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Traf3Q60803 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Traf3Q60803 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Traf3Q60803 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Traf3Q60803 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Traf3Q60803 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Traf3Q60803 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Traf3Q60803 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Traf3Q60803 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Traf3Q60803 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Traf3Q60803 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Traf3Q60803 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Traf3Q60803 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Traf3Q60803 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Traf3Q60803 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Traf3Q60803 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Traf3Q60803 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Traf3Q60803 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Traf3Q60803 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Traf3Q60803 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Traf3Q60803 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Traf3Q60803 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Traf3Q60803 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Traf3Q60803 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Traf3Q60803 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Traf3Q60803 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Traf3Q60803 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Traf3Q60803 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Traf3Q60803 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Traf3Q60803 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Traf3Q60803 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Traf3Q60803 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Traf3Q60803 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Traf3Q60803 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Traf3Q60803 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Traf3Q60803 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Traf3Q60803 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Traf3Q60803 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Traf3Q60803 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Traf3Q60803 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Traf3Q60803 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Traf3Q60803 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Traf3Q60803 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Traf3Q60803 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Traf3Q60803 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Traf3Q60803 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Traf3Q60803 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Traf3Q60803 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Traf3Q60803 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Traf3Q60803 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Traf3Q60803 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Traf3Q60803 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Traf3Q60803 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Traf3Q60803 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Traf3Q60803 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Traf3Q60803 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Traf3Q60803 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Traf3Q60803 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Traf3Q60803 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Traf3Q60803 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Traf3Q60803 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Traf3Q60803 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Traf3Q60803 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Traf3Q60803 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms