Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWP3

Nacad, NAC-alpha domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NacadQ5SWP3 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NacadQ5SWP3 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NacadQ5SWP3 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NacadQ5SWP3 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NacadQ5SWP3 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NacadQ5SWP3 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NacadQ5SWP3 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NacadQ5SWP3 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
NacadQ5SWP3 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NacadQ5SWP3 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NacadQ5SWP3 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NacadQ5SWP3 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NacadQ5SWP3 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NacadQ5SWP3 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NacadQ5SWP3 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NacadQ5SWP3 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NacadQ5SWP3 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NacadQ5SWP3 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NacadQ5SWP3 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NacadQ5SWP3 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NacadQ5SWP3 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
NacadQ5SWP3 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NacadQ5SWP3 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NacadQ5SWP3 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NacadQ5SWP3 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NacadQ5SWP3 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NacadQ5SWP3 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NacadQ5SWP3 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NacadQ5SWP3 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
NacadQ5SWP3 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
NacadQ5SWP3 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NacadQ5SWP3 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NacadQ5SWP3 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NacadQ5SWP3 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NacadQ5SWP3 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NacadQ5SWP3 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NacadQ5SWP3 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NacadQ5SWP3 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NacadQ5SWP3 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NacadQ5SWP3 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NacadQ5SWP3 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NacadQ5SWP3 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NacadQ5SWP3 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NacadQ5SWP3 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NacadQ5SWP3 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NacadQ5SWP3 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NacadQ5SWP3 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NacadQ5SWP3 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NacadQ5SWP3 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NacadQ5SWP3 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NacadQ5SWP3 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NacadQ5SWP3 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NacadQ5SWP3 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NacadQ5SWP3 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NacadQ5SWP3 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NacadQ5SWP3 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NacadQ5SWP3 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NacadQ5SWP3 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NacadQ5SWP3 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NacadQ5SWP3 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NacadQ5SWP3 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
NacadQ5SWP3 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NacadQ5SWP3 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
NacadQ5SWP3 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NacadQ5SWP3 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NacadQ5SWP3 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
NacadQ5SWP3 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
NacadQ5SWP3 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
NacadQ5SWP3 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NacadQ5SWP3 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NacadQ5SWP3 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NacadQ5SWP3 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
NacadQ5SWP3 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NacadQ5SWP3 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
NacadQ5SWP3 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NacadQ5SWP3 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NacadQ5SWP3 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NacadQ5SWP3 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NacadQ5SWP3 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NacadQ5SWP3 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NacadQ5SWP3 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NacadQ5SWP3 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NacadQ5SWP3 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NacadQ5SWP3 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NacadQ5SWP3 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NacadQ5SWP3 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NacadQ5SWP3 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NacadQ5SWP3 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NacadQ5SWP3 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NacadQ5SWP3 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NacadQ5SWP3 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NacadQ5SWP3 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NacadQ5SWP3 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NacadQ5SWP3 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NacadQ5SWP3 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NacadQ5SWP3 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NacadQ5SWP3 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
NacadQ5SWP3 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
NacadQ5SWP3 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
NacadQ5SWP3 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms