Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Trappc1Q5NCF2 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Trappc1Q5NCF2 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Trappc1Q5NCF2 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Trappc1Q5NCF2 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Trappc1Q5NCF2 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Trappc1Q5NCF2 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Trappc1Q5NCF2 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Trappc1Q5NCF2 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Trappc1Q5NCF2 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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