Protein–RNA interactions for Protein: Q5F204

Mdh1b, Putative malate dehydrogenase 1B, mousemouse

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Length 500 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Mdh1bQ5F204 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mdh1bQ5F204 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Mdh1bQ5F204 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Mdh1bQ5F204 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Mdh1bQ5F204 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mdh1bQ5F204 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mdh1bQ5F204 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mdh1bQ5F204 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mdh1bQ5F204 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mdh1bQ5F204 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mdh1bQ5F204 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mdh1bQ5F204 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mdh1bQ5F204 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mdh1bQ5F204 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mdh1bQ5F204 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mdh1bQ5F204 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mdh1bQ5F204 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mdh1bQ5F204 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Mdh1bQ5F204 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mdh1bQ5F204 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.1 ms