Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1H1

Ckap2, Cytoskeleton-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2Q3V1H1 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms