Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW68

Capn13, Calpain-13, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn13Q3UW68 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Capn13Q3UW68 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Capn13Q3UW68 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Capn13Q3UW68 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Capn13Q3UW68 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Capn13Q3UW68 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Capn13Q3UW68 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Capn13Q3UW68 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Capn13Q3UW68 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Capn13Q3UW68 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Capn13Q3UW68 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Capn13Q3UW68 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Capn13Q3UW68 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Capn13Q3UW68 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Capn13Q3UW68 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Capn13Q3UW68 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Capn13Q3UW68 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Capn13Q3UW68 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Capn13Q3UW68 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Capn13Q3UW68 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Capn13Q3UW68 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Capn13Q3UW68 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Capn13Q3UW68 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Capn13Q3UW68 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Capn13Q3UW68 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Capn13Q3UW68 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Capn13Q3UW68 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Capn13Q3UW68 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Capn13Q3UW68 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Capn13Q3UW68 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Capn13Q3UW68 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Capn13Q3UW68 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.08■□□□□ 0
Capn13Q3UW68 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Capn13Q3UW68 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Capn13Q3UW68 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Capn13Q3UW68 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Capn13Q3UW68 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Capn13Q3UW68 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Capn13Q3UW68 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Capn13Q3UW68 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Capn13Q3UW68 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Capn13Q3UW68 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Capn13Q3UW68 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Capn13Q3UW68 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Capn13Q3UW68 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Capn13Q3UW68 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capn13Q3UW68 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capn13Q3UW68 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Capn13Q3UW68 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capn13Q3UW68 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capn13Q3UW68 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capn13Q3UW68 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capn13Q3UW68 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Capn13Q3UW68 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Capn13Q3UW68 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Capn13Q3UW68 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Capn13Q3UW68 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Capn13Q3UW68 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Capn13Q3UW68 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Capn13Q3UW68 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capn13Q3UW68 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Capn13Q3UW68 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Capn13Q3UW68 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capn13Q3UW68 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capn13Q3UW68 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capn13Q3UW68 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capn13Q3UW68 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Capn13Q3UW68 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Capn13Q3UW68 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capn13Q3UW68 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capn13Q3UW68 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capn13Q3UW68 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capn13Q3UW68 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Capn13Q3UW68 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Capn13Q3UW68 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Capn13Q3UW68 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capn13Q3UW68 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capn13Q3UW68 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Capn13Q3UW68 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Capn13Q3UW68 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Capn13Q3UW68 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Capn13Q3UW68 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Capn13Q3UW68 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Capn13Q3UW68 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Capn13Q3UW68 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Capn13Q3UW68 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Capn13Q3UW68 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Capn13Q3UW68 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Capn13Q3UW68 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Capn13Q3UW68 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Capn13Q3UW68 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Capn13Q3UW68 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Capn13Q3UW68 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Capn13Q3UW68 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Capn13Q3UW68 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Capn13Q3UW68 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Capn13Q3UW68 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Capn13Q3UW68 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Capn13Q3UW68 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Capn13Q3UW68 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms