Protein–RNA interactions for Protein: Q3UIW8

Rnf224, RING finger protein 224, mousemouse

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf224Q3UIW8 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rnf224Q3UIW8 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf224Q3UIW8 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf224Q3UIW8 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf224Q3UIW8 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf224Q3UIW8 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf224Q3UIW8 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf224Q3UIW8 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf224Q3UIW8 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf224Q3UIW8 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf224Q3UIW8 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf224Q3UIW8 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf224Q3UIW8 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf224Q3UIW8 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf224Q3UIW8 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf224Q3UIW8 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf224Q3UIW8 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf224Q3UIW8 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf224Q3UIW8 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf224Q3UIW8 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf224Q3UIW8 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf224Q3UIW8 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf224Q3UIW8 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf224Q3UIW8 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf224Q3UIW8 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf224Q3UIW8 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf224Q3UIW8 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf224Q3UIW8 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf224Q3UIW8 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf224Q3UIW8 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf224Q3UIW8 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf224Q3UIW8 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf224Q3UIW8 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf224Q3UIW8 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnf224Q3UIW8 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnf224Q3UIW8 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnf224Q3UIW8 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnf224Q3UIW8 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnf224Q3UIW8 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnf224Q3UIW8 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnf224Q3UIW8 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnf224Q3UIW8 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnf224Q3UIW8 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnf224Q3UIW8 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnf224Q3UIW8 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnf224Q3UIW8 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnf224Q3UIW8 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnf224Q3UIW8 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnf224Q3UIW8 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnf224Q3UIW8 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnf224Q3UIW8 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnf224Q3UIW8 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnf224Q3UIW8 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnf224Q3UIW8 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnf224Q3UIW8 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnf224Q3UIW8 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnf224Q3UIW8 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnf224Q3UIW8 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnf224Q3UIW8 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnf224Q3UIW8 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnf224Q3UIW8 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnf224Q3UIW8 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnf224Q3UIW8 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnf224Q3UIW8 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Rnf224Q3UIW8 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Rnf224Q3UIW8 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnf224Q3UIW8 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Rnf224Q3UIW8 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnf224Q3UIW8 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnf224Q3UIW8 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnf224Q3UIW8 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnf224Q3UIW8 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnf224Q3UIW8 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnf224Q3UIW8 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnf224Q3UIW8 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnf224Q3UIW8 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnf224Q3UIW8 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnf224Q3UIW8 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnf224Q3UIW8 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnf224Q3UIW8 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnf224Q3UIW8 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnf224Q3UIW8 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnf224Q3UIW8 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnf224Q3UIW8 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnf224Q3UIW8 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnf224Q3UIW8 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnf224Q3UIW8 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnf224Q3UIW8 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnf224Q3UIW8 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnf224Q3UIW8 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnf224Q3UIW8 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnf224Q3UIW8 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnf224Q3UIW8 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnf224Q3UIW8 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnf224Q3UIW8 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnf224Q3UIW8 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnf224Q3UIW8 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.5 ms